Реставрационные работы обошлись правительству в 11 000 000 рублей. В настоящий момент работы проводятся также в Воскресенском храме. В скором времени планируется отреставрировать колокольню и несколько помещений Вологодского кремля.
В результате проведенных работ заменены опоры подкрестных столбов, отреставрированы кресты, восстановлены элементы декора, заменены некоторые детали конструкции. Деревянные части храма законсервировали с помощью специального огнебиозащитного состава, кирпичный свод утеплили.